オルガノイドに基づく免疫ペプチドミクスにより、膵臓がんに限定された潜在性抗原が明らかに

背景と理論的根拠

膵管腺がん（PDAC）は、免疫チェックポイント阻害薬やその他のT細胞免疫療法に対する反応性が低いことが特徴です。PDACの特徴は、腫瘍の変異負荷が低～中程度であることであり、従来の変異由来ネオアンチゲンの利用可能性は著しく制限されています。

この生物学的現実は、根本的な方法論的疑問を提起します。PDACのような低変異がんにおいて、変異由来ネオアンチゲンは適切な抗原空間なのでしょうか？

最近のScience誌に掲載された研究は、戦略の決定的な転換を提案しています。著者らは、古典的な新抗原を推測するのではなく、患者由来の膵臓がんオルガノイドに免疫ペプチドミクスを適用して、腫瘍細胞がT細胞に実際に提示するものを直接調べました。

抗原提示の直接的な読み取りとしての免疫ペプチドミクス

免疫ペプチドミクスは、免疫ペプチドーム、すなわち主要組織適合遺伝子複合体（MHC）分子（ヒトではHLA）に結合し、細胞表面に提示されるペプチドの完全なレパートリーに焦点を当てています。

免疫学的観点から見ると、これはT細胞監視に利用可能な有効な抗原ランドスケープを表しています。ゲノム解析やトランスクリプトーム解析とは異なり、免疫ペプチドミクスは以下の情報を捉えます。

• 抗原プロセシングとプロテアソームによる切断
• ペプチド輸送とMHCへのローディング
• ペプチド-MHC複合体の安定性と細胞表面提示

したがって、免疫ペプチドミクスは、T細胞免疫の中心的なメカニズムに関する疑問に直接答えます。つまり、腫瘍細胞によって物理的に提示され、TCR認識にアクセスできるペプチドはどれか？

本研究では、HLAクラスI関連ペプチドを、HLA-ペプチド複合体をそのまま免疫親和性精製し、LC-MS/MSに基づくペプチド同定によって単離しました。このワークフローにより、結合予測のみに依存することが回避され、非標準的なゲノム領域に由来するものも含め、提示された抗原の偏りのない検出が可能になります。

続きはこちら 著者: Bio X Cell

注目製品：

• BE0079 – InVivo MAb anti-human MHC Class I (HLA-A, HLA-B, HLA-C)

• BE0469 – InVivo MAb anti-human HLA-A2

• BE0483 – InVivo MAb anti-human HLA-E

• BE0452 – InVivo MAb anti-human pan MHC Class II (HLA-II)

参考文献：

1. Ely, ZA, et al (2025) Pancreatic cancer-restricted cryptic antigens are targets for T cell recognition. Science. 388(6747):eadk3487. doi: 10.1126/science.adk3487.

2. Tuveson, DA. (2025) The hunt for common tumor antigens. Science. 388(6747):592-593. doi: 10.1126/science.adx8688.

3. Feola, S, et al (2023) Integrating immunopeptidome analysis for design and development of cancer vaccines. Seminars in Immunology. 67:101750. doi: 10.1016/j.smim.2023.101750.

4. Admon, A. (2023) The biogenesis of the immunopeptidome. Seminars in Immunology. 67:101766. doi: 10.1016/j.smin.2023.101766.

5. Kina, E, et al (2025) The cryptic immunopeptidome in health and disease. Trends in Genetics. 412(2):162-169. doi: 10.1016/j.tig.2024.09.003.